En el mes de marzo del año 2005, John Green daría a conocer su primera novela “Buscando a Alaska”. Es la historia de Miles, un muchacho de 16 años que va a un semi-internado y allí conoce a Alaska, una enigmática chica. Inspirada en su época de estudiante trata los polos de la soledad y el amor presentes en las relaciones. Esta novela le valió un buen comienzo en el mundo literario ocupando los primeros puestos en ventas, sería catalogado como el mejor libro del año y se le otorgaría el premio Michael L. Printz de parte de la American Library Association.
Debido al éxito que seguía cultivando Buscando a Alaska, la búsqueda de comprar sus derechos para realizar una producción cinematográfica no se hizo esperar, siendo vendido en 2005 a la compañía productora Paramount Pictures Corporation, pero el proyecto finalmente no se llevó a cabo si no hasta el 2019 en formato de serie.
En 2008 publica Ciudades de Papel, una historia que gira en torno a dos adolescentes, en su último año de secundaria, que viven en Orlando, Florida. Quentin Jacobsen y Margo Roth Spiegelman. Quentin está perdidamente enamorado de Margo, pero pertenecen a mundos distintos. Colabora en la escritura del libro Noches blancas. Dos años más tarde publicaría Will Grayson, Will Grayson, una novela que coescribió con David Levithan.
En enero del año 2012 lanzaría su obra “Bajo la misma estrella”, ésta se basaría principalmente en las experiencias que vivió Green en Nationwide. La novela trata sobre una adolescente de 16 años con cáncer quien presionada por sus padres, empieza a asistir a las reuniones de un grupo de apoyo, donde conoce a Augusto Waters, quien había perdido una pierna también por un cáncer que estaba en remisión.
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